荧光原位杂交技术(Fluorescence in situ hybridization FISH)是通过荧光素标记的核苷酸探针与细胞核内的靶序列杂交,以获得细胞内染色体或基因状态的信息。
技术特点:
靶向检测,需要根据检测位点确定需要的探针
可检测染色体的数目、结构异常;
可检测基因片段的缺失或重复;
可检测染色体平衡易位和微缺失
以往FISH检测主要用于产前及流组织的遗传学诊断,即对13号、18号、21号常染色体及X、Y性染色体的数目异常进行检测。随着液相基因芯片检测技术(BoBs)的出现,FISH的这些功能逐渐被取代。目前FISH检测主要用于染色体结构畸变的再验证。即:
o 额外微小标记染色体的确认
o 缺失(deletion,del )
o 重复(duplication,dup)
o 倒位(inversion,inv)
o 易位(translocation,t)
o 插入(insertion,ins)
o 双着丝粒染色体(dicentric chromosome,dic)
【FISH验证】
北京贝康医学检验所具有丰富的FISH探针库,除具备常规FISH探针外,对于一些特殊位点,可提供定制探针的验证服务。
适用类别:
· 对核型分析、CMA检测结果的再验证;
· 对微缺失微重复综合征进行验证;
· 对异常结果进行家系追踪,了解来源,评估再孕风险。
案例分享:FISH对CMA异常结果来源的验证
患者信息:女童,7岁,儿童智力体格发育迟缓,送检外周血进行CMA检测。
检测结果:arr5q14.3(87,538,430-89,565,757)x1
结果解释:
患儿的CMA芯片检测结果显示该患者5号染色体5q14.3区段存在2.0Mb片段缺失,内含MEF2C基因,文献报告显示该片段缺失可导致包括有刻板性动作型智力低下, 癫痫, 大脑发育异常,发育迟缓,婴儿痉挛,自闭症等临床症状的5q14.3缺失综合征。
采用FISH验证有助于确认该缺失的的表现形式,家系验证有助于确认该缺失是否为新发生的变异。
家系FISH验证结果
患儿:ish del(5)(q14.3q14.3)(RP11-293L20-)
母亲:ish 5q14.3(RP11-293L20)x2
父亲:ish 5q14.3(RP11-293L20)x2
结果解释:
5q14.3区段的BAC探针RP11-293L20对患儿家系进行FISH检测,结果显示父母的5号染色体正常,而患儿的5号染色体存在缺失,患儿的5号染色体异常为新发生的变异。
病例解析:
患儿CMA芯片检测发现5号染色体存在缺失,其家系的FISH检测排除了父母一方为ins(?;5)(?;q14.3q14.3)染色体插入的携带者,确定患儿的异常为新发生的变异,父母再孕复发风险较低。
SNP芯片与FISH的组合明确了患者的病因以及染色体异常的表现形式和遗传形式。